Образовательная концепция богословского факультета строится на основании синтеза традиций дореволюционной русской богословской школы, православного богословия XX века и современной отечественной и зарубежной науки. Главная цель богословского факультета — подготовка студентов к пастырскому, миссионерскому и церковно-практическому служению, образовательной и научной деятельности в духе верности святоотеческому Преданию, Священноначалию Русской Православной Церкви и Отечеству. Факультет проводит Ежегодную международную богословскую конференцию ПСТГУ. Проводятся совместные конференции с Гумбольдт-университетом Берлина, Восточным интитутом в Риме и другими.