Двухуровневая система подготовки успешно реализуется на факультете с 1996 г. Физфак динамично развивается, интеграция ЯрГУ и ФТИАН открыла студентам доступ к самому современному технологическому и аналитическому оборудованию Центра коллективного пользования «Диагностика микро- и наноструктур». Высокий уровень теоретической и экспериментальной подготовки студентов обеспечивается высокой квалификацией преподавательского состава.