Инженерно-экономический факультет является самым молодым факультетом в вузе. Он был организован в 1993 году. В настоящее время контингент обучающихся на факультете составляет порядка 570 студентов. Особенностью обучения на ИЭФ является ориентация экономической и инженерно-технической подготовки выпускников на региональные особенности. ИЭФ поддерживает тесные связи с промышленными предприятиями и организациями Ярославской области. В Ярославской торгово-промышленной палате создан филиал кафедры «Экономика и управление». На базе ИЭФ осуществляется получение второго высшего образования по специальностям «Экономика и управление на предприятиях химической промышленности», «Экономика и управление в строительстве», «Экономика» и «Менеджмент». Центр «Экономика и управление» проводит переподготовку специалистов в течение 5 лет.