Основной задачей факультета является подготовка высококвалифицированных специалистов, обладающих профессиональными навыками для эффективной работы в бюджетно-финансовой сфере, в первую очередь, в системе финансового контроля федерального, регионального и местного уровня, в подразделениях внутреннего контроля (аудита) государственных учреждений и корпораций, в аудиторских организациях.
Обучение в Высшей школе государственного аудита МГУ осуществляется по образовательным программам высшего образования по направлениям: «Юриспруденция» и «Экономика». На факультете фундаментальное образование, составляющее основу классического университетского образования по экономике и юриспруденции, сочетается с углубленной профессиональной ориентацией учащихся в рамках соответствующих профилей подготовки юристов и экономистов.