Государственный университет морского и речного флота имени адмирала С.О. Макарова образован в 2012 году объединением двух высших учебных заведений: Санкт-Петербургского государственного университета водных коммуникаций - старейшего транспортного ВУЗа России, образованного в 1809 году как Институт Корпуса инженеров водяных и сухопутных сообщений, и Государственной морской академии имени адмирала С.О. Макарова.
При подготовке выпускников по морским направлениям образования в университете учитываются требования Международной конвенции о подготовке и дипломировании моряков и несении вахты. ГУМРФ является членом девяти международных ассоциаций.
Университет располагает собственной автошколой для подготовки водителей категории В. Научно-исследовательская работа ведется в пяти научных школах, а также на факультетах и кафедрах университета.